La dépose du ballon est réalisée après 6 mois. Le ballon n'est plus efficace, car l'estomac s'est adapté à lui.

Les sécrétions gastriques le rendent poreux. il alors peut se dégonfler et aller dans l'intestin. Il y a un risque d'occlusion.

Le ballon gastrique est retiré de la même façon qu'il a été mis en place :

   - par l'oesophage et par la bouche, 
   - sans intervention chirurgicale.

Le retrait est réalisée sous anesthésie générale ambulatoire, avec intubation et sous contrôle endoscopique.
La dépose dure en moyenne un quart d'heure.

Le gastroentérologue met en place le fibroscope dans l'estomac.
Il perfore le ballon, aspire le liquide situé à l'intérieur du ballon, saisit le ballon dégonflé et l'extrait par l'œsophage, puis la bouche.